Het bestuur van de stichting bestaat uit:

• Pieter Hofstra - voorzitter
• Cees Tommel (Keyrail) - penningmeester- uit de groep Nederlandse Havens 
• Pieter Kraaijeveld (ProRail) - uit de groep infrastructuur managers
• Joost van de Kar (Ewals Cargo Care) - uit de groep rail logistieke dienstverleners
• Rob van Gansewinkel (Husa Transportation Group) - uit de groep railgoederenvervoerders
• Thom Heijselaar (Glencore Grain BV) - uit de groep klanten van het spoor

Het ministerie van Verkeer en Waterstaat is subsidieverlener en waarnemer van het bestuur. Het ministerie wordt vertegenwoordigd door Brigit Gijsbers van het Directoraat Generaal Mobiliteit. 

Pieter Hofstra
Pieter Hofstra is voorzitter van het stichtingsbestuur. Hij was van 1994 tot 2006 lid van de Tweede Kamer namens de VVD. Sinds 12 juni 2007 is de heer Hofstra lid van de Eerste Kamer der Staten-Generaal. Pieter Hofstra volgde de HBS en studeerde Civiele Techniek aan de Technische Hogeschool Delft en studeerde af in de spoorwegbouwkunde. In de Tweede Kamer hield Hofstra zich bezig met het woon- en bouwbeleid en met openbaar vervoer en goederenvervoer.

Cees Tommel
Cees Tommel is directeur van Keyrail, de organisatie die zorg draagt voor de exploitatie van de Betuweroute. Hij heeft een lange ervaring in de transportsector waar hij werkzaam is geweest bij Railion. Daarna heeft hij gewerkt bij het Havenbedrijf Rotterdam NV als manager beleid ontwikkeling infrastructuur. Hij is binnen het Havenbedrijf actief betrokken geweest bij het opstellen van de Businesscase Exploitatie Betuweroute.

Pieter Kraaijeveld
Pieter Kraaijeveld zit namens ProRail in het bestuur. Hij is sinds 1 augustus 2007 directeur capaciteitsmanagement binnen de Prorail organisatie. Voorheen was hij directeur spoorontwikkeling bij ProRail en heeft hij gewerkt voor de Schiphol Group.

Joost van de Kar
Joost van de Kar is werkzaam bij logistiek dienstverlener Ewals Cargo Care. Hij is hier verantwoordelijk voor intermodaal vervoer. Ewals heeft vestigingen in Venlo (hoofdkantoor), Moerdijk en Genk (B). Zij verlenen een breed scala aan logistieke diensten voor de automotive sector, consumenten elektronica, verpakkingsindustrie, petro-chemische industrie, retail, high-tech en de zware industrie.

Rob van Gansewinkel
Rob van Gansewinkel is directeur eigenaar van de Husa Transportation Group. De Husa Transportation Group is een groep van bedrijven die zich ten doel stelt uit te groeien tot een Europese regisseur van intermodale logistieke oplossingen met de modaliteit spoor als “key-differentiator”. Met vestigingen in Nederland, Duitsland en Zwitserland is de Husa Transportation Group een toonaangevende partij in de Europese markt voor railgoederenvervoer. Belangrijk onderdeel van de Husa Transportion Group vormt de railgoederenvervoerder ACTS. ACTS verzorgt al jarenlang het vervoer per spoor van containers tussen Veendam en Rotterdam en Leeuwarden en Rotterdam.

Thom Heijselaar
Thom Heijselaar is werkzaam bij de firma Glencore Grain BV gevestigd te Rotterdam. Hij is hier verantwoordelijk voor de back-office Europe. Glencore Grain is actief in de import en export van agrarische produkten. Voor het vervoer binnen Europe wordt veelvuldig spoor ingezet. Zij leveren onder andere grondstoffen voor de productie van mengvoeders.